登州卫 青州左卫 莱州卫 宁海卫 济南卫 平山卫 安东卫 (已下添设)灵山卫 鳌山卫 大嵩卫 威海卫 成山卫 靖海卫 东昌卫 临清卫(旧兖州左护卫，后改) 任城卫济宁卫(旧武昌左护卫，后改) 兖州护卫 胶州千户所 诸城千户所 滕县千户所 肥城千户所(已下添设) 海阳千户所 东平千户所 宁津千户所 雄崖千户所 浮山前千户所 福山中前千户所 奇山千户所 濮州千户所 金山左千户所 寻山后千户所 百尺崖后千户所 王徐寨前千户所 夏河寨前千户所 鲁府仪卫司 德府仪卫司 泾府仪卫司 衡府仪卫司德府群牧所 泾府群牧所 衡山群牧所
◎右军都督府
○在京
留守右卫 虎贲右卫 武德卫(俱南京旧卫，永乐十八年分调)
在外
△直隶
宣州卫(旧无，后设)
陕西都司(旧有阶州卫、沙州卫、灵山千户所，后俱革。)
西安右护卫(旧泰山卫改) 西安左卫 西安前卫 西安后卫 延安卫 汉中卫 平凉卫 绥德卫 宁夏卫 庆阳卫 巩昌卫 临洮卫 兰州卫 秦州卫岷州卫旧军民指挥使司，嘉靖二十四年添设岷州，四十年革，(后存卫) 河州卫(旧军民指挥使司) 洮州卫 宁夏中护卫 甘州中护卫 安东中护卫 宁夏前卫(已下各卫旧无，后设) 宁夏中卫 宁夏中屯卫(旧和州卫) 宁夏左屯卫宁夏右屯卫 宁羌卫 靖虏卫 固原卫 榆林卫 宁夏后卫(以花马池千户所改)兴安千户所(旧金州千户所，万历十年改)凤翔千户所 礼店前千户所(以下各所旧设) 沔县千户所 环县千万所 文县千户所 阶州千户所(旧属秦州卫，嘉靖二十二年改属都司) 灵州千户所 西安千户所 西固城千户所，归德千户所 镇羌千户所 安边千户所 平虏千户所 兴武营千户所 镇戎千户所 宁夏平虏千户所 秦府仪卫司 庆府仪卫司 肃府仪卫司 韩府仪卫司 宁夏群牧所安东群牧所 甘州群牧所
陕西行都司(洪武十二年添设)
甘州左卫 甘州右卫 甘州中卫 甘州前卫 甘州后卫(已上陕西甘肃卫分设) 永昌卫 凉州卫 庄浪卫 西宁卫 山丹卫 (已上旧属陕西都司) 肃州卫 镇番卫 镇夷千户所 古浪千户所 高台千户所
四川都司(旧有浦江关军民千户所，后革)
成都左护卫 成都右卫 成都中卫 成都前卫 成都后卫 宁川卫 茂州卫重庆卫 叙南卫 泸州卫 利州卫(旧无，后设) 松潘卫(旧为军民指挥使司，后改) 青川千户所 保宁千户所 威州千户所 雅州千户所 大渡河千户所 广安千户所 灌县千户所 (已下各所后设) 黔江千户所 叠溪千户所建武千户所 小河千户所 蜀府仪卫司 寿府仪卫司(革) 寿府群牧所(革)
土官
天全六番招讨使司(属都司) 陇木头长官司 静州长官司 岳希蓬长官司(已上属茂州卫) 石砫宣抚司 西阳宣抚司 (已上属重庆卫) 石耶洞长官司 邑梅洞长官司 (已上属酉阳宣抚司) 占藏先结簇长官司 蜡匝簇长官司 白马路簇长官司发 山洞簇长官司 阿昔洞簇长官司 北定簇长官司 麦匝簇长官司 者多簇长官司 牟力簇长官司 班班簇长官司 祈命簇长官司 勒都簇长官司 包藏簇长官司 阿思簇长官司 思曩儿簇长官司 阿用簇长官司潘斡寨长官司 八郎安抚司 阿角寨安抚司 麻儿匝安抚司 芒儿者安抚司(已上俱属松潘卫) 叠溪长官司 郁即长官司(已上属叠溪千户所)
四川行都司(旧无，后设。旧有建昌前卫，后革)
建昌卫(旧属四川都司) 宁番卫(旧为苏州卫，属四川都司已下添设)会川卫 盐井卫 越巂卫 礼州后千户所 礼州中中千户所 建昌打冲河中前千户所 德昌千户所 迷易千户所 盐井打冲河中左千户所 冕山桥后千户所 镇西后千户所
土官