福建都司
福州中卫 福州左卫 福州右卫 兴化卫 泉州卫 漳州卫 福宁卫 镇东卫 平海卫 永宁卫 镇海卫
福建行都司
建宁左卫 建宁右卫 建阳卫(革) 延平卫 邵武卫 汀州卫 将乐千户所
江西都司
南昌左卫 南昌前卫 袁州卫 赣州卫 吉安卫(后为千户所) 饶州千户所 安福千户所 会昌千户所 永新千户所 南安千户所 建昌千户所 抚州千户所 铅山千户所 广信千户所
广东都司
广州前卫 广州左卫 广州右卫 南海卫 潮州卫 雷州卫 海南卫 清远卫 惠州卫 肇庆卫 广州后卫 程乡千户所 高州千户所 廉州千户所(后为廉州卫) 万州千户所 儋州千户所 崖州千户所 南雄千户所 韶州千户所德庆千户所 新兴千户所 阳江千户所 新会千户所 龙川千户所
◎后军都督府
○在京
横海卫 鹰扬卫 兴武卫(调北京) 江阴卫 蒙古左卫(革) 蒙古右卫(革)
在外
△北平都司
燕山左卫 燕山右卫 燕山前卫 大兴左卫 永清左卫 永清右卫 济州卫济阳卫 彭城卫 通州卫(已上俱改为亲军) 蓟州卫 密云卫(后为密云后卫，属后府) 真定卫 永平卫 山海卫 遵化卫 居庸关千户所(后为隆庆卫已上俱属后府)
北平行都司(后为大宁都司)大宁左卫 大宁右卫 (二卫后为营州左、右护卫，改延庆左、右卫) 大宁中卫 大宁前卫 大宁后卫(后为营州中护卫，改宽河卫) 会州卫(俱改调京卫 已上俱属后府) 营州中护卫 兴州中护卫(革)
△山西都司
太原左卫 太原右卫 太原前卫 振武卫 平阳卫 镇西卫 潞州卫 蒲州千户所 广昌千户所 沁州千户所 宁化千户所 雁门千户所
山西行都司