帝以荆州刺史司马休之宗室之重，又得江、汉人心，疑其 有异志；而休之子谯王文思在都，招聚轻侠，帝执送休之，令 自爲其所。休之表废文思，并与帝书陈谢。
十一年正月，帝收休之子文宝、兄子文祖，并赐死，率衆 西讨。复假黄钺，领荆州刺史。以中军将军道怜监留府事。休 之上表自陈，并罪状帝。休之府录事参军韩延之有干用才，帝 未至江陵，密书招之。延之报书曰：“承亲率戎马，远履西偏， 阖境士庶，莫不惶骇。辱疏，知以谯王前事，良增叹息。司马 平西体国忠贞，款怀待物，以公有匡复之勋，家国蒙赖，推德 委诚，每事询仰。谯王往以微事见劾，犹自表逊位；况以大过 而当默邪！来示云，‘处怀期物，自有由来 ’。今伐人之君， 啖人以利，真可谓‘处怀期物’者矣。刘藩死于阊阖之门，诸 葛毙于左右之手，甘言诧方伯，袭之以轻兵，遂使席上靡款怀 之士，阃外无自信诸侯，以爲得算，良所耻也。吾虽鄙劣，尝 闻道于君子，以平西之至德，宁可无授命之臣乎？假天长丧乱， 九流浑浊，当与臧洪游于地下。不复多云。”帝视书叹息，以 示将佐曰：“事人当如此。”
三月，军次江陵。初，雍州刺史鲁宗之负力好乱，且虑不 爲帝容，常爲谶曰：“鱼登日，辅帝室。”与休之相结。至是， 率其子竟陵太守轨会于江陵。帝济江，休之衆溃，与轨等奔襄 阳，江陵平。加领南蛮校尉。将拜南蛮，遇四废日，佐史郑鲜 之等白迁日，不许。下书开宽大之恩。 四月，进军襄阳，休之等奔姚兴。晋帝复申前令，授太傅、 扬州牧，剑履上殿，入朝不趋，赞拜不名，加前部羽葆、鼓吹， 置左右长史、司马、从事中郎四人，封第三子义隆爲北彭城县 公。八月甲子，帝至自江陵，奉还黄钺，固辞太傅、州牧、前 部羽葆、鼓吹，其馀受命。
十二年正月，晋帝诏帝依旧辟士，加领平北将军、兖州刺 史，增督南秦，凡二十二州。帝以平北文武寡少，不宜别置， 于是罢平北府，以并大府。三月，加帝中外大都督。
初，帝平齐，仍有定关、洛意，遇卢循侵逼，故寝。及荆、 雍平，乃谋外略。会姚兴死，子泓新立，兄弟相杀，关中扰乱。 四月乙丑，帝表伐关、洛，乃戒严北讨，加领征西将军、司豫 二州刺史。以世子爲徐、兖二州刺史。帝欲以义声怀远，奉琅 邪王北伐。五月，庐江霍山崩，获六锺，献之天子。癸巳，加 领北雍州刺史，前后部羽葆、鼓吹，增班剑爲四十人。八月丁 巳，率大衆进发，以世子爲中军将军，监太尉留府事，尚书右 仆射刘穆之爲左仆射，领监军、中军二府军司，入居东府，总 摄内外。九月，帝至彭城，加领北徐州刺史。十月，衆军至洛， 围金墉，降之。修复晋五陵，置守卫。
十二月壬申，晋帝加帝位相国、总百揆、扬州牧，封十郡 爲宋公，备九锡之礼，加玺绂、远游冠、绿綟绶，位在诸侯王 上。策曰：
朕以寡昧，仰缵洪基，夷羿乘衅，荡覆王室，越在南鄙， 迁于九江。宗祀绝飨，人神无位，提挈群凶，寄命江浦，则我 祖宗之烈，奄坠于地，七百之祚，翦焉既倾，若涉巨海，罔知 攸济。天未绝晋，诞育英辅，振厥弛维，再造区宇，兴亡继绝， 俾昏作明，元勋至德，朕实攸赖。
今将授公典策，其敬听朕命：乃者，桓玄肆僭，滔天泯夏， 拔本塞源，颠蹶六位，庶僚俛眉，四方莫恤。公精贯朝日，气 陵虹蜺，奋其灵武，大歼群慝，克复皇邑，奉歆神只。此公之 大节始于勤王者也。授律群后，泝流长骛，薄伐峥嵘，献捷南 郢，大憝折首，群逆毕夷，三光旋采，旧物反正。此又公之功 也。出藩入辅，弘兹保弼，阜财利用，繁殖黎元，编户岁滋， 疆宇日啓，导德明刑，四境有截。此又公之功也。鲜卑负衆， 僭盗三齐，介恃遐阻，仍爲边害，公搜乘秣马，敻入远疆，冲 橹四临，万雉俱溃，拓土三千，申威龙漠。此又公之功也。卢 循祅凶，伺隙五岭，侵覆江、豫，矢及王城，国议迁都之规， 家献徙卜之计，公乘辕南济，义形于色，运奇摅略，英谟不世， 狡寇穷衄，丧旗宵遁，俾我畿甸，拯于将坠。此又公之功也。 追奔逐北，扬旍江濆，偏旅浮海，指日遄至，番禺之功，俘级 万数，左里之捷，鸟散鱼溃，元凶远窜，传首万里。此又公之 功也。刘毅叛换，负衅西夏，陵上罔主，志肆奸暴，公御轨以 刑，消之不日，罪人斯得，荆、衡甯晏。此又公之功也。谯纵 怙乱，寇窃一隅，王化阻阂，三巴沦溺，公指命偏帅，授以良 图，陵波凭湍，致届井络，僭竖伏鑕，梁、岷草偃。此又公之 功也。马休、鲁宗，阻兵内侮，驱率二方，连旗称乱，公投袂 星言，研其上略，江津之师，势踰风电，回旆沔川，实繁震慑， 二叛奔迸，荆、雍来苏。此又公之功也。永嘉不竞，四夷擅华， 五都倾荡，山陵幽辱，祖宗怀没世之愤，遗甿有匪风之思，公 远齐阿衡纳隍之仁，近同小白灭亡之耻，鞠旅陈师，赫然大号， 分命群帅，北徇司、兖，许、郑风靡，巩、洛载清，百年榛秽， 一朝扫涤。此又公之功也。
公有康宇内之勋，重之以明德。爰初发迹，则奇谟冠古， 电击强祅，则锋无前对，聿宁东畿，大造黔首。若乃草昧经纶， 化融于岁计，扶危静乱，道固于苞桑。蠲削烦苛，较若画一， 淳风美化，盈塞区宇。是以绝域献琛，遐夷纳赆，王略所宣， 九服率从。虽文命之东渐西被，咎繇之迈于种德，何以尚兹。 朕闻先王之宰世也，庸勋尊贤，建侯胙土，褒以宠章，崇 其徽物，所以协辅皇室，永隆藩屏。故曲阜光啓，遂荒徐宅， 营丘表海，四履有闻。其在襄王，亦赖匡霸，又命晋文，备物 光赐。惟公道冠前烈，勋高振古，而殊典未饰，朕甚懵焉！今 进授相国，以徐州之彭城沛兰陵下邳淮阳山阳广陵、兖州之高 平鲁泰山十郡封公爲宋公，锡兹玄土，苴以白茅，爰定尔居， 用建冢社。昔晋、郑啓藩，入作卿士，周、召保傅，出总二南， 内外之任，公实兼之。今命使持节、兼太尉、尚书左仆射晋宁 县五等男湛授相国印绶，宋公玺绂，使持节、兼司空、散骑常 侍、尚书阳遂乡侯泰授宋公茅土，金虎符第一至第五左，竹使 符第一至第十左。相国位无不总，礼绝朝班，居常之名，宜与 事革。其以相国总百揆，去录尚书之号；上送所假节、侍中貂 蝉、中外都督太傅太尉印绶、豫章公印策；进扬州刺史爲牧， 领征西将军、司豫北徐雍四州刺史如故。
公纪纲礼度，万国是式，乘介蹈方，罔有迁志，是用锡公 大路、戎路各一，玄牡二驷；公抑末敦本，务农重积，采蘩实 殷，稼穑惟阜，是用锡公衮冕之服，赤舄副焉；公闲邪纳正， 移风改俗，陶钧品物，如乐之和，是用锡公轩县之乐、六佾之 舞；公宣美王化，导扬休风，华夷企踵，远人胥萃，是用锡公 朱户以居；公官方任能，网罗幽滞，九臯辞野，髦士盈朝，是 用锡公纳陛以登；公当轴处中，率下以义，式遏寇雠，涤除苛 慝，是用锡公虎贲之士三百人；公明罚恤刑，庶狱详允，放命 干纪，罔有攸纵，是用锡公鈇钺各一；公龙骧凤矫，咫尺八紘， 括囊四海，折冲无外，是用锡公彤弓一、彤矢百，玈弓十、玈 矢千；公温恭孝思，致虔禋祀，忠肃之志，仪刑四方，是用锡 公秬鬯一卣，圭瓒副焉。宋国置丞相以下，一遵旧仪。钦哉， 其祗服往命，茂对天休，简恤庶邦，敬敷显德，以终我高祖之 嘉命！置宋国侍中、黄门侍郎、尚书左丞，即随大使奉迎。 枹罕虏乞伏炽盘遣使谒帝，求效力讨姚泓，拜爲平西将军、 河南公。
十三年正月，帝以舟师进讨，留彭城公义隆镇彭城。军次 陈留城，经张良庙，下令以时修饰栋宇致荐焉。晋帝追赠帝祖 爲太常，父爲特进、左光禄大夫，让不受。二月，冠军将军檀 道济等军次潼关。三月庚辰，帝率大军入河。五月，帝至洛阳， 谒晋五陵。七月，至陕，龙骧将军王镇恶舟师自河浮渭。八月， 扶风太守沈田子大破姚泓军于蓝田，王镇恶克长安，禽姚泓。 始义熙九年，岁、镇、荧惑、太白聚东井，至是而关中平。九 月，帝至长安。长安丰稔，帑藏盈积，帝先收其彜器、浑仪、 土圭、记里鼓、指南车及秦始皇玉玺送之都；其馀珍宝珠玉， 悉以班赐将帅。迁姚宗于江南，送泓斩于建康市。谒汉长陵， 大会文武于未央殿。
十月，晋帝诏进宋公爵爲王，加十郡益宋国，并前爲二十 郡。其相国、扬州牧、领征西将军、司豫北徐雍四州刺史如故。 帝欲息驾长安，经略赵、魏，十一月，前将军刘穆之卒，乃归。 十二月庚子，发自长安，以桂阳公义真爲雍州刺史，镇长安， 留腹心将佐以辅之。
十四年正月壬戌，帝至彭城，解严息甲。以辅国将军刘遵 考爲并州刺史，领河东太守，镇蒲阪。帝解司州，领徐、冀二 州刺史，固让进爵。时汉中成固县汉水崖际有异声如雷，俄顷 岸崩，有铜锺十二，出自潜壤。巩县人宗曜于其田所获嘉禾， 九穗同茎，帝以献，晋帝以归于我。帝冲让，乃止。 六月丁亥，受相国宋公九锡之命，下命赦国内殊死以下。 诏崇豫章太夫人爲宋公太妃，世子爲中军将军副贰，相国府百 官悉依天朝之制。又诏宋国所封十郡之外，悉得除用。 先是，安西中兵参军沈田子杀安西司马王镇恶，诸将杀安 西长史王修，关中乱。十月，帝遣右将军朱龄石代安西将军桂 阳公义真爲雍州刺史。义真还，爲赫连勃勃所追，大败，仅以 身免，诸将帅及龄石并没。
十二月，晋安帝崩，大司马琅邪王即帝位。 元熙元年正月，晋帝诏征帝入辅，又申前令，进公爵爲王， 以徐州之海陵北东海北谯北梁、豫州之新蔡、兖州之北陈留、 司州之陈郡汝南潁川荥阳十郡，增宋国。七月，乃受命。赦国 内五岁刑以下，迁都寿阳。九月，解扬州。十二月，晋帝命帝 冕十有二旒，建天子旌旗，出警入跸，乘金根车，驾六马，备 五时副车，置旄头云罕，乐舞八佾，设锺虡宫县。进王太妃爲 太后，王妃爲王后，世子爲太子，王子、王孙爵命之号，一如 旧仪。 二年正月，帝表让殊礼。竟陵郡江滨自开，出古铜礼器十 余枚，帝献之晋帝，让不受，于是归诸瑞物，藏于相府。四月， 诏遣敦劝，兼征帝入辅。六月壬戌，帝至都。甲寅，晋帝禅位 于宋。有司草诏既成，请书之，天子即便操笔，谓左右曰 ： “桓玄之时，天命已改，重爲刘公所延，将二十载。今日之事， 本所甘心。”甲子，遣使奉策曰：
咨尔宋王，夫玄古权舆，悠哉邈矣，其详靡得而闻。爰自 书契，降逮三、五，莫不以上圣君四海，止戈定大业。然则帝 王者，宰物之通器，君道者，天下之至公也。昔在上叶，深鉴 兹道，是以天禄既终，唐、虞弗得传其嗣，符命来格，舜、禹 不获全其谦。所以经纬三才，澄序彜化，作范振古，垂风万叶， 莫尚于兹。自是厥后，历代弥劭。汉既嗣德于放勋，魏亦方轨 于重华，谅以协谋乎人鬼，而以百姓爲心者也。
昔我祖宗钦明，辰居其极，而明晦代序，盈亏有期，翦商 兆祸，非惟一世，曾是弗克，矧伊在今，天之所废，有自来矣。 惟王体上圣之姿，包二仪之德，明齐日月，道合四时。乃者， 社稷倾覆，王拯而存之，中原芜梗，又济而复之。自负固不宾， 干纪放命，肆逆滔天，窃据万里，靡不润之以风雨，震之以雷 霆。九伐之道既敷，八法之化自理，岂伊博施于人，济斯黔庶， 固已义洽四海，道盛八荒者矣。至于上天垂象，四灵效征，图 谶之文既明，人神之望已改，百工歌于朝，庶人颂乎野，亿兆 抃踊，倾伫惟新。自非百姓乐推，天命攸集，岂伊在予所得独 专。是用仰祗皇灵，俯顺群议，敬禅神器，授帝位于尔躬。大 祚其穷，天禄永终。于戏！王其允执其中，敬遵典训，副率土 之嘉愿，恢洪业于无穷，时膺休佑，以答三灵之眷望。又遣使 持节、兼太保、散骑常侍、光禄大夫谢澹，兼太尉、尚书刘宣 范奉玺书，归皇帝玺绶，受终之礼，一如唐虞、汉魏故事。帝 奉表陈让，晋帝已逊于琅邪王第，表不获通。于是陈留王虔嗣 等二百七十人及宋台群臣并上表劝进，犹不许。太史令骆达陈 天文符应曰：“案晋义熙元年至元熙元年，太白昼见经天凡 七，占曰：‘太白经天，人更主，异姓兴。’义熙七年，五虹 见于东方，占曰：‘五虹见，天子黜，圣人出。’九年，镇星、 岁星、太白、荧惑聚于东井。十三年，镇星入太微 。占曰：‘ 镇星守太微，有立王,有徙王。’元熙元年冬，黑龙四登于天， 易传曰：‘冬，龙见，天子亡社稷，大人受命。’冀州道人释 法称告其弟子曰：‘嵩神言，江东有刘将军，汉家苗裔，当受 天命，吾以璧三十二、镇金一饼与之，刘氏卜世之数也。’汉 建武至建安末一百九十六年而禅魏，魏自黄初至咸熙末四十六 年而禅晋，晋自泰始至今百五十六年，三代揖让，咸穷于六。 又汉光武社于南阳，汉末而其树死，刘备有蜀，乃应之而兴； 及晋季年，旧根始萌，至是而盛矣。”若此者有数十条。群臣 又固请，乃从之。
永初元年夏六月丁卯，皇帝即位于南郊，设坛，柴燎告天 曰：
皇帝臣裕敢用玄牡，昭告于皇皇后帝：
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